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La neumonitis y traqueobronquitis por Herpes Simple usualmente afecta pacientes inmunocomprometidos. Con frecuencia se observan células multinucleadas con inclusiones intranucleares eosinofílicas. El diagnóstico puede confirmarse con estudios de inmunoperoxidasas.
El citomegalovirus con frecuencia causa infecciones oportunistas, con infiltrados pulmonares difusos. Los cambios virales, que son los mismos observados en otros sitios, se observan en las células bronquiales o neumocitos y son : células con aumento de tamaño, con grandes inclusiones intranucleares con un halo y pequeñas inclusiones citoplasmáticas basofílicas. El diagnóstico puede confirmare con estudios e inmunoperoxidasas, inmunofluorescencia o hibridización in situ.
La neumonitis por sarampión usualmente ocurre en niños inmunocomprometidos, produce una neumonia de células gigantes; observando células gigantes multinucleadas epiteliales con inclusiones eosinofílicas intranucleares y citoplasmáticas. Los mismos hallazgos son típicos de las infecciones por virus sincitial respiratorio.
En las infecciones por Adenovirus, las células tienen una apariencia borrosa debido a una gran inclusión que ocupa el núcleo y ciliocitoftoria que puede ser pronunciada: esta semeja un penacho de pelo y representa un desprendimiento de la barra terminal y cilias de las células bronquiales.